du.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Inheritance beyond plain heritability: variance-controlling genes in Arabidopsis thaliana
Högskolan Dalarna, Akademin Industri och samhälle, Statistik.ORCID-id: 0000-0003-4390-1979
Högskolan Dalarna, Akademin Industri och samhälle, Statistik.ORCID-id: 0000-0002-1057-5401
2012 (Engelska)Ingår i: PLOS Genetics, ISSN 1553-7390, E-ISSN 1553-7404, Vol. 8, nr 8, artikel-id e1002839Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

The phenotypic effect of a gene is normally described by the mean-difference between alternative genotypes. A gene may, however, also influence the phenotype by causing a difference in variance between genotypes. Here, we reanalyze a publicly available Arabidopsis thaliana dataset [1] and show that genetic variance heterogeneity appears to be as common as normal additive effects on a genomewide scale. The study also develops theory to estimate the contributions of variance differences between genotypes to the phenotypic variance, and this is used to show that individual loci can explain more than 20% of the phenotypic variance. Two well-studied systems, cellular control of molybdenum level by the ion-transporter MOT1 and flowering-time regulation by the FRI-FLC expression network, and a novel association for Leaf serration are used to illustrate the contribution of major individual loci, expression pathways, and gene-by-environment interactions to the genetic variance heterogeneity.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2012. Vol. 8, nr 8, artikel-id e1002839
Nationell ämneskategori
Genetik
Forskningsämne
Komplexa system - mikrodataanalys, Statistisk modellering är grunden till en ökad förståelse inom genetik!; Komplexa system - mikrodataanalys, Allmänt Mikrodataaanalys - metod
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:du-10538DOI: 10.1371/journal.pgen.1002839ISI: 000308529300006PubMedID: 22876191OAI: oai:DiVA.org:du-10538DiVA, id: diva2:543921
Forskningsfinansiär
Forskningsrådet FormasTillgänglig från: 2012-08-10 Skapad: 2012-08-10 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(903 kB)85 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 903 kBChecksumma SHA-512
bae5bdff2b2930bedb126896f552b98eec19bd8142c1eff3fa8eb513c0372eded608012e9af37cf56b164399290442625971f959cdaee9fa7a54d180cf681648
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Personposter BETA

Shen, XiaRönnegård, Lars

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Shen, XiaRönnegård, Lars
Av organisationen
Statistik
I samma tidskrift
PLOS Genetics
Genetik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 85 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 735 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf