du.sePublikasjoner
Endre søk
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
qtl.outbred: Interfacing outbred line cross data with the R/qtl mapping software
Högskolan Dalarna, Akademin Industri och samhälle, Statistik.ORCID-id: 0000-0003-4390-1979
2011 (engelsk)Inngår i: BMC Research Notes, ISSN 1756-0500, E-ISSN 1756-0500, Vol. 4, nr 154Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert) Published
Abstract [en]

Background

qtl.outbred is an extendible interface in the statistical environment, R, for combining quantitative trait loci (QTL) mapping tools. It is built as an umbrella package that enables outbred genotype probabilities to be calculated and/or imported into the software package R/qtl.

Findings

Using qtl.outbred, the genotype probabilities from outbred line cross data can be calculated by interfacing with a new and efficient algorithm developed for analyzing arbitrarily large datasets (included in the package) or imported from other sources such as the web-based tool, GridQTL.

Conclusion

qtl.outbred will improve the speed for calculating probabilities and the ability to analyse large future datasets. This package enables the user to analyse outbred line cross data accurately, but with similar effort than inbred line cross data.

sted, utgiver, år, opplag, sider
BioMed Central, 2011. Vol. 4, nr 154
HSV kategori
Forskningsprogram
Komplexa system - mikrodataanalys
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:du-10641DOI: 10.1186/1756-0500-4-154OAI: oai:DiVA.org:du-10641DiVA, id: diva2:548298
Merknad

Open access

Tilgjengelig fra: 2012-08-30 Laget: 2012-08-30 Sist oppdatert: 2017-12-07bibliografisk kontrollert

Open Access i DiVA

fulltext(1007 kB)122 nedlastinger
Filinformasjon
Fil FULLTEXT02.pdfFilstørrelse 1007 kBChecksum SHA-512
2c7407e89a9b3592d8091b2c486bec619121027c06a9b7ca57799543b4e27a48233145ecb62b87a771e11354cbbd68fbcaef74d637caf7aa54af7df4863171f6
Type fulltextMimetype application/pdf

Andre lenker

Forlagets fulltekst

Personposter BETA

Shen, Xia

Søk i DiVA

Av forfatter/redaktør
Shen, Xia
Av organisasjonen
I samme tidsskrift
BMC Research Notes

Søk utenfor DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 128 nedlastinger
Antall nedlastinger er summen av alle nedlastinger av alle fulltekster. Det kan for eksempel være tidligere versjoner som er ikke lenger tilgjengelige

doi
urn-nbn

Altmetric

doi
urn-nbn
Totalt: 921 treff
RefereraExporteraLink to record
Permanent link

Direct link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf