du.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
qtl.outbred: Interfacing outbred line cross data with the R/qtl mapping software
Högskolan Dalarna, Akademin Industri och samhälle, Statistik.ORCID-id: 0000-0003-4390-1979
2011 (Engelska)Ingår i: BMC Research Notes, ISSN 1756-0500, E-ISSN 1756-0500, Vol. 4, nr 154Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Background

qtl.outbred is an extendible interface in the statistical environment, R, for combining quantitative trait loci (QTL) mapping tools. It is built as an umbrella package that enables outbred genotype probabilities to be calculated and/or imported into the software package R/qtl.

Findings

Using qtl.outbred, the genotype probabilities from outbred line cross data can be calculated by interfacing with a new and efficient algorithm developed for analyzing arbitrarily large datasets (included in the package) or imported from other sources such as the web-based tool, GridQTL.

Conclusion

qtl.outbred will improve the speed for calculating probabilities and the ability to analyse large future datasets. This package enables the user to analyse outbred line cross data accurately, but with similar effort than inbred line cross data.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
BioMed Central, 2011. Vol. 4, nr 154
Nationell ämneskategori
Naturvetenskap
Forskningsämne
Komplexa system - mikrodataanalys
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:du-10641DOI: 10.1186/1756-0500-4-154OAI: oai:DiVA.org:du-10641DiVA, id: diva2:548298
Anmärkning

Open access

Tillgänglig från: 2012-08-30 Skapad: 2012-08-30 Senast uppdaterad: 2017-12-07Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1007 kB)126 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.pdfFilstorlek 1007 kBChecksumma SHA-512
2c7407e89a9b3592d8091b2c486bec619121027c06a9b7ca57799543b4e27a48233145ecb62b87a771e11354cbbd68fbcaef74d637caf7aa54af7df4863171f6
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Personposter BETA

Shen, Xia

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Shen, Xia
Av organisationen
Statistik
I samma tidskrift
BMC Research Notes
Naturvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 132 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 923 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • chicago-author-date
  • chicago-note-bibliography
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf